饮用矿泉水生产过程中的灭菌是确保产品安全卫生的重要工序，包括矿泉水灭菌、生产环境（主要是灌装车间）的灭菌和容器（主要为瓶和盖子）的灭菌。
一．矿泉水灭菌
矿泉水灭菌主要有两种方法：臭氧灭菌和紫外线灭菌。在前几天我们以分别详细做过介绍，在此不再赘述。
紫外线杀菌有两点不足之处：一是紫外线剂量不足的情况下不能有效的杀灭病原体，无持久杀菌能力，不能解决消毒后管网中的再次污染问题；二是水中的生物，悬浮物等会沉积在紫外灯罩表面，时间久后会影响杀菌效果。
紫外线杀菌消毒的不足之处，用臭氧杀菌的方式可以完全避免，臭氧杀菌器是常用的杀菌器，在水处理中得到了广泛的应用，它不但有高的杀菌率，还有持续杀菌的效果。
臭氧的杀菌效果主要取决于水中臭氧的含量，水中臭氧的含量越高，杀菌的效果越佳。而水中臭氧的浓度又取决于进入水中的臭氧气体浓度、水温和臭氧在水中的分散程度。当通入的臭氧气体浓度越高，水温越低，臭氧在水中的分散程度越高。臭氧与水的混合越充分，水中臭氧含量越高，杀菌效果自然越好。常见的臭氧发生器的种类有两种，一种是臭氧混合塔混合，另外一种是射流器混合。
值得注意的是，紫外线照射时往往存在死角，未被照射的部分，细菌仍然活着，有些芽孢还没有被杀灭，在装瓶后又很快生长繁殖，造成细菌指标超标。在桶装水的生产上，规模小的基本上普遍采用简单的臭氧先进入水射器的方法或紫外线杀菌，规模大的桶装水厂会采用臭氧混合塔的方法或者紫外线杀菌和臭氧混合塔并行的方法同步运行，因为产量大，必须彻底有效的避免细菌的滋生。
二．灌装车间的灭菌
灌装生产车间的无菌环境对产品质量至关重要。生产前，要对灌装车间进行彻底的清洁卫生工作，彻底消毒灭菌，不留死角，对四壁、顶壁、地面和设备，尤其是灌装机、冲瓶机等与产品接触的部分，更要彻底进行。生产期间还应定期灭菌，要注意保持车间干燥，不积水，以减少微生物生长繁殖的机会。安装空气净化装置，对进入灌装车间的空气进行过滤除菌，排除外界空气对车间的污染，一般要求洁净空气中细菌总数不大于150个/m3，霉菌不得检出。
三．矿泉水的瓶、盖灭菌
矿泉水瓶子和盖子是直接和矿泉水接触的，稍有细菌污染，产品就不合格，因此，必须严格有效地进行灭菌处理。国内厂家对瓶、盖灭菌的消毒剂，比较常用的有高锰酸钾、双氧乙酸等，消毒后，应用无菌矿泉水冲洗干净，采用臭氧、紫外线照射等方法对矿泉水瓶和盖子灭菌，也可达到良好的灭菌效果。
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