医院的水源绝大部分来自市政自来水，因此原水的指标符合《生活饮用水卫生标准》。但是医院很多专业科室均需要对原水进行水质处理才能达到实际使用的要求，由于水质指标要求的差异性从而决定了医用集中制水、分质供水的系统特性。
医疗用水按水质指标差异主要分如下几种：
1.血液透析用水：原水经净水系统处理后滤除固形颗粒、细菌、病毒、内毒素、有害离子，供血透机用水和透析液配制用水，终端水质指标达到血液透析和相关治疗用水标准（yy0572-2005）。使用科室主要为：血透中心、icu等。
2.器械清洗消毒用水：原水经净水系统处理后滤除固形颗粒、细菌、病毒、有害离子，终端水质指标达到《医院消毒供应中心-第1部分管理规范》（ws310.1-2009）和《医院消毒供应中心-第2部分清洗消毒及灭菌技术操作规范》（ws310.2-2009）的相关要求。使用科室主要为：中心供应室、手术部供应室、手术部洗消间、内镜清洗室、dsa导管清洗间、口腔科、中心供应室等。
3.生化检验用水：原水经净水系统处理后几乎滤除全部杂质和离子，终端水质指标达到《中国国家实验室分析用水标准》（gb/t6682-2008）中一级水指标和2005版药典纯化水指标。使用科室主要为：生化检验科、病理科、药物配置中心等。
4.手术刷手用水：原水经净水系统处理后滤除滤除固形颗粒、细菌、病毒，终端水质指标离子指标与原水基本一致，固形颗粒和细菌的滤除率>99%，因此又被称为无菌冲洗水。
5.饮用纯水：原水经净水系统处理后滤除固形颗粒、细菌、病毒、有害离子，终端水质指标达到《饮用纯净水质量指标》（gb17324-2003）的指标要求。使用科室主要为：医疗候诊区、办公区、护士站等。
6.酸性氧化电位水：酸性氧化电位水是一种低成本、高效、广谱消毒剂，原水经净水系统处理后滤除固形颗粒、细菌、病毒、有害离子，经氧化电位水生成器电解后制成酸性、高氧化电位、富含有效氯的消毒剂，水质指标满足《医院消毒供应中心-第2部分清洗消毒及灭菌技术操作规范》（ws310.2-2009）酸性氧化电位水的理化指标。广泛应用于：消毒供应中心、病区洗消间、重症监护室（icu）、妇产科、儿科、口腔科、血透中心、传染科、感染科、发热门诊、环境消毒等需要常规消毒剂的科室与部门。
以上6种水基本上涵盖了一个综合性医院的医疗用水种类，其他类型的特殊用水可以根据具体的要求在以上6种水的基础上对制水工艺微调就可以实现。
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